Aktiviti akuakultur di Wilayah KEJORA mula dipergiatkan pada tahun 1984 apabila KEJORA telah melantik Universiti Pertanian Malaysia telah membuat kajian awal kesesuaian air untuk perusahaan akuakultur jenis air masin dan air payau untuk ternakan seperti udang harimau, udang putih, ikan siakap, ikan kerapu dan juga pusat penetasan. Kawasan akuakultur seluas 2,660 hektar yang terletak di sepanjang Sungai Lebam, Sungai Bauh Besar dan Sungai Papan  di Kota Tinggi, Johor.

Objektif Program Akuakultur

• Menggalakkan pertumbuhan pelaburan dalam sektor industri akuakultur di wilayah
• Mengkomersilkan kawasan tanah terbiar iaitu kawasan paya bakau untuk dijadikan satu kawasan pembangunan projek akuakultur
• Mengeluarkan bekalan makanan untuk pasaran tempatan dan eksport
• Mewujudkan peluang pekerjaan dan pendapatan

Pembangunan Akuakultur di wilayah KEJORA ini telah berjaya mewujudkan sekurang-kurangnya 200 peluang pekerjaan. Pengeluaran hasil akuakultur adalah dianggarkan sebanyak 70 metrik tan setahun dengan jumlah pelaburan melebihi RM32.0 juta iaitu bermula dari peringkat awal pelaksanaannnya sehingga kini.